Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl3P27659 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl3P27659 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl3P27659 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl3P27659 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl3P27659 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl3P27659 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl3P27659 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl3P27659 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl3P27659 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl3P27659 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl3P27659 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl3P27659 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl3P27659 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl3P27659 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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