Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccnd1P25322 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms