Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NdnP25233 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NdnP25233 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NdnP25233 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NdnP25233 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NdnP25233 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NdnP25233 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NdnP25233 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NdnP25233 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NdnP25233 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NdnP25233 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NdnP25233 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NdnP25233 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NdnP25233 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NdnP25233 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NdnP25233 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NdnP25233 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NdnP25233 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NdnP25233 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NdnP25233 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NdnP25233 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NdnP25233 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NdnP25233 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NdnP25233 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NdnP25233 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NdnP25233 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NdnP25233 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NdnP25233 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NdnP25233 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NdnP25233 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NdnP25233 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NdnP25233 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NdnP25233 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NdnP25233 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NdnP25233 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NdnP25233 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NdnP25233 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NdnP25233 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NdnP25233 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NdnP25233 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NdnP25233 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NdnP25233 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NdnP25233 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NdnP25233 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NdnP25233 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NdnP25233 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NdnP25233 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NdnP25233 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NdnP25233 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NdnP25233 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NdnP25233 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NdnP25233 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NdnP25233 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NdnP25233 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NdnP25233 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NdnP25233 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NdnP25233 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NdnP25233 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NdnP25233 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NdnP25233 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NdnP25233 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NdnP25233 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NdnP25233 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NdnP25233 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NdnP25233 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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NdnP25233 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NdnP25233 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NdnP25233 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NdnP25233 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NdnP25233 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NdnP25233 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NdnP25233 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NdnP25233 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NdnP25233 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NdnP25233 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NdnP25233 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NdnP25233 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NdnP25233 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NdnP25233 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NdnP25233 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NdnP25233 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NdnP25233 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NdnP25233 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NdnP25233 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NdnP25233 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NdnP25233 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NdnP25233 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NdnP25233 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NdnP25233 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NdnP25233 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NdnP25233 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NdnP25233 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NdnP25233 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NdnP25233 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NdnP25233 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NdnP25233 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NdnP25233 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NdnP25233 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NdnP25233 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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