Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Olfr1077-ps1-201ENSMUST00000213225 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Gm21897-201ENSMUST00000178312 1500 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 9430065F17Rik-203ENSMUST00000223845 1380 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Gm20281-201ENSMUST00000188225 267 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Gm6657-204ENSMUST00000211288 1091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 AC154742.1-201ENSMUST00000223477 573 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Vmn2r-ps118-201ENSMUST00000176785 908 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 4930440C22Rik-201ENSMUST00000185490 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Gm15103-201ENSMUST00000119893 871 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Gm15104-201ENSMUST00000132626 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Gm38326-201ENSMUST00000194030 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 D830005E20Rik-202ENSMUST00000219691 971 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Iltifb-201ENSMUST00000163808 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Gm8023-201ENSMUST00000195298 903 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 2510017J16Rik-201ENSMUST00000198718 1263 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxd11P23813 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Gm10330-201ENSMUST00000072014 1354 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
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