Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ggta1P23336 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms