Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PparaP23204 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PparaP23204 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PparaP23204 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PparaP23204 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PparaP23204 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PparaP23204 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PparaP23204 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PparaP23204 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PparaP23204 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PparaP23204 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PparaP23204 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PparaP23204 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PparaP23204 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PparaP23204 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PparaP23204 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PparaP23204 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PparaP23204 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PparaP23204 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PparaP23204 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PparaP23204 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PparaP23204 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PparaP23204 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PparaP23204 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PparaP23204 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PparaP23204 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PparaP23204 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PparaP23204 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PparaP23204 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PparaP23204 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PparaP23204 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PparaP23204 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PparaP23204 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PparaP23204 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PparaP23204 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PparaP23204 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PparaP23204 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PparaP23204 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PparaP23204 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PparaP23204 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PparaP23204 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PparaP23204 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PparaP23204 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PparaP23204 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PparaP23204 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PparaP23204 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PparaP23204 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PparaP23204 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PparaP23204 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PparaP23204 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PparaP23204 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PparaP23204 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PparaP23204 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PparaP23204 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PparaP23204 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PparaP23204 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PparaP23204 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PparaP23204 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PparaP23204 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PparaP23204 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PparaP23204 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PparaP23204 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PparaP23204 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PparaP23204 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PparaP23204 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PparaP23204 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PparaP23204 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PparaP23204 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PparaP23204 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PparaP23204 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PparaP23204 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PparaP23204 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PparaP23204 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PparaP23204 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PparaP23204 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PparaP23204 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PparaP23204 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PparaP23204 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PparaP23204 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PparaP23204 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PparaP23204 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PparaP23204 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PparaP23204 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PparaP23204 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PparaP23204 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PparaP23204 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PparaP23204 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PparaP23204 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PparaP23204 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PparaP23204 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PparaP23204 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PparaP23204 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PparaP23204 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PparaP23204 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PparaP23204 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PparaP23204 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PparaP23204 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PparaP23204 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PparaP23204 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PparaP23204 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms