Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VimP20152 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VimP20152 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VimP20152 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VimP20152 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VimP20152 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VimP20152 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VimP20152 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VimP20152 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VimP20152 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VimP20152 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VimP20152 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VimP20152 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
VimP20152 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VimP20152 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VimP20152 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VimP20152 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VimP20152 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VimP20152 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VimP20152 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VimP20152 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VimP20152 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VimP20152 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VimP20152 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VimP20152 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VimP20152 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VimP20152 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VimP20152 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VimP20152 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VimP20152 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VimP20152 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VimP20152 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VimP20152 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VimP20152 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VimP20152 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VimP20152 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VimP20152 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VimP20152 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VimP20152 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VimP20152 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VimP20152 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VimP20152 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VimP20152 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VimP20152 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VimP20152 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VimP20152 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VimP20152 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VimP20152 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VimP20152 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VimP20152 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VimP20152 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VimP20152 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VimP20152 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VimP20152 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VimP20152 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VimP20152 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VimP20152 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VimP20152 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VimP20152 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VimP20152 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VimP20152 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VimP20152 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VimP20152 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VimP20152 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VimP20152 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VimP20152 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VimP20152 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
VimP20152 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VimP20152 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VimP20152 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VimP20152 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VimP20152 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VimP20152 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VimP20152 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VimP20152 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VimP20152 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VimP20152 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VimP20152 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VimP20152 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VimP20152 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VimP20152 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VimP20152 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VimP20152 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VimP20152 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VimP20152 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VimP20152 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VimP20152 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VimP20152 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VimP20152 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VimP20152 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VimP20152 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VimP20152 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VimP20152 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VimP20152 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VimP20152 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VimP20152 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VimP20152 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VimP20152 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VimP20152 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VimP20152 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms