Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tnnc1P19123 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnc1P19123 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms