Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RargP18911 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RargP18911 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RargP18911 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RargP18911 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RargP18911 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RargP18911 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RargP18911 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RargP18911 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RargP18911 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RargP18911 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RargP18911 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RargP18911 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RargP18911 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RargP18911 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RargP18911 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RargP18911 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RargP18911 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RargP18911 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RargP18911 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RargP18911 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RargP18911 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RargP18911 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RargP18911 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RargP18911 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RargP18911 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RargP18911 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RargP18911 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RargP18911 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RargP18911 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RargP18911 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RargP18911 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RargP18911 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RargP18911 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RargP18911 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RargP18911 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RargP18911 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RargP18911 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RargP18911 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RargP18911 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RargP18911 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RargP18911 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RargP18911 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RargP18911 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RargP18911 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RargP18911 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RargP18911 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RargP18911 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RargP18911 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RargP18911 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RargP18911 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RargP18911 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RargP18911 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RargP18911 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RargP18911 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RargP18911 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RargP18911 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RargP18911 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RargP18911 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RargP18911 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RargP18911 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RargP18911 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RargP18911 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RargP18911 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RargP18911 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RargP18911 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RargP18911 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RargP18911 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RargP18911 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RargP18911 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RargP18911 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RargP18911 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RargP18911 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RargP18911 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RargP18911 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RargP18911 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RargP18911 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RargP18911 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RargP18911 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RargP18911 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RargP18911 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RargP18911 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RargP18911 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RargP18911 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RargP18911 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RargP18911 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RargP18911 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RargP18911 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RargP18911 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RargP18911 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RargP18911 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RargP18911 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RargP18911 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RargP18911 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RargP18911 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RargP18911 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RargP18911 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RargP18911 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RargP18911 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RargP18911 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms