Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18528 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18528 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18528 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18528 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18528 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18528 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18528 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18528 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18528 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18528 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18528 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18528 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18528 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18528 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18528 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18528 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18528 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18528 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18528 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18528 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18528 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18528 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18528 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18528 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18528 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18528 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18528 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18528 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18528 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P18528 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18528 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18528 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18528 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18528 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18528 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18528 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18528 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18528 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18528 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18528 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18528 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18528 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18528 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P18528 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P18528 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P18528 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
P18528 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P18528 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P18528 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P18528 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P18528 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P18528 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P18528 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P18528 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18528 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18528 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18528 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18528 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18528 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
P18528 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18528 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18528 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18528 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18528 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18528 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18528 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18528 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
P18528 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18528 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18528 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18528 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18528 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18528 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18528 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18528 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18528 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18528 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18528 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18528 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18528 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18528 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18528 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18528 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18528 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18528 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18528 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18528 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18528 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18528 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18528 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18528 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18528 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18528 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18528 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18528 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18528 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18528 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18528 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18528 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms