Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18524 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P18524 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18524 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18524 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18524 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18524 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18524 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18524 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18524 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18524 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18524 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18524 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18524 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18524 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18524 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18524 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18524 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18524 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18524 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18524 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18524 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18524 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18524 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18524 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18524 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18524 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18524 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18524 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18524 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18524 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18524 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18524 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18524 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18524 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18524 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18524 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18524 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18524 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18524 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18524 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18524 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18524 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18524 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18524 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18524 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P18524 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18524 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P18524 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P18524 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18524 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18524 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18524 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18524 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18524 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18524 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18524 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18524 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18524 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18524 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18524 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18524 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18524 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18524 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18524 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18524 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18524 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18524 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18524 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18524 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18524 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18524 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18524 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18524 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18524 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18524 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18524 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18524 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18524 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18524 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18524 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18524 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18524 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18524 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18524 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18524 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18524 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P18524 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18524 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18524 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18524 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18524 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18524 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18524 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18524 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18524 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18524 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18524 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P18524 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P18524 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms