Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SptbP15508 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SptbP15508 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SptbP15508 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SptbP15508 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SptbP15508 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SptbP15508 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SptbP15508 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SptbP15508 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SptbP15508 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SptbP15508 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SptbP15508 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SptbP15508 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SptbP15508 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SptbP15508 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SptbP15508 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SptbP15508 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SptbP15508 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SptbP15508 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SptbP15508 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SptbP15508 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SptbP15508 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SptbP15508 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SptbP15508 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SptbP15508 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SptbP15508 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SptbP15508 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SptbP15508 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SptbP15508 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SptbP15508 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SptbP15508 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SptbP15508 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SptbP15508 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SptbP15508 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SptbP15508 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SptbP15508 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SptbP15508 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SptbP15508 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SptbP15508 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SptbP15508 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SptbP15508 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SptbP15508 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SptbP15508 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SptbP15508 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SptbP15508 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SptbP15508 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SptbP15508 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SptbP15508 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SptbP15508 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SptbP15508 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SptbP15508 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SptbP15508 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SptbP15508 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SptbP15508 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SptbP15508 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SptbP15508 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SptbP15508 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SptbP15508 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SptbP15508 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SptbP15508 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SptbP15508 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SptbP15508 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SptbP15508 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SptbP15508 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SptbP15508 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SptbP15508 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SptbP15508 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SptbP15508 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SptbP15508 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SptbP15508 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SptbP15508 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SptbP15508 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SptbP15508 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SptbP15508 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SptbP15508 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SptbP15508 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SptbP15508 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SptbP15508 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SptbP15508 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SptbP15508 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SptbP15508 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SptbP15508 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SptbP15508 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SptbP15508 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SptbP15508 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SptbP15508 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SptbP15508 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SptbP15508 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SptbP15508 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SptbP15508 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SptbP15508 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SptbP15508 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SptbP15508 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SptbP15508 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SptbP15508 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SptbP15508 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SptbP15508 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SptbP15508 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SptbP15508 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SptbP15508 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms