Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb1P13372 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms