Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr4a1P12813 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms