Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DmdP11531 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DmdP11531 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DmdP11531 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DmdP11531 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DmdP11531 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DmdP11531 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DmdP11531 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DmdP11531 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DmdP11531 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DmdP11531 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DmdP11531 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DmdP11531 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DmdP11531 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DmdP11531 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DmdP11531 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DmdP11531 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DmdP11531 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DmdP11531 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DmdP11531 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DmdP11531 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DmdP11531 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DmdP11531 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DmdP11531 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DmdP11531 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DmdP11531 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DmdP11531 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
DmdP11531 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DmdP11531 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DmdP11531 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DmdP11531 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DmdP11531 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DmdP11531 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DmdP11531 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DmdP11531 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DmdP11531 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DmdP11531 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DmdP11531 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DmdP11531 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DmdP11531 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DmdP11531 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DmdP11531 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DmdP11531 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DmdP11531 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DmdP11531 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DmdP11531 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DmdP11531 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DmdP11531 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DmdP11531 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DmdP11531 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DmdP11531 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DmdP11531 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DmdP11531 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DmdP11531 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DmdP11531 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DmdP11531 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DmdP11531 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DmdP11531 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DmdP11531 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DmdP11531 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DmdP11531 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DmdP11531 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DmdP11531 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DmdP11531 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DmdP11531 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DmdP11531 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DmdP11531 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DmdP11531 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DmdP11531 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DmdP11531 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DmdP11531 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DmdP11531 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DmdP11531 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DmdP11531 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DmdP11531 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DmdP11531 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DmdP11531 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DmdP11531 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DmdP11531 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DmdP11531 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DmdP11531 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DmdP11531 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DmdP11531 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DmdP11531 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DmdP11531 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DmdP11531 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DmdP11531 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DmdP11531 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DmdP11531 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DmdP11531 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DmdP11531 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DmdP11531 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DmdP11531 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DmdP11531 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DmdP11531 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DmdP11531 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DmdP11531 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DmdP11531 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DmdP11531 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DmdP11531 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms