Protein–RNA interactions for Protein: P09174

Pde6g, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6gP09174 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Pde6gP09174 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Pde6gP09174 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Pde6gP09174 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Pde6gP09174 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Pde6gP09174 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Pde6gP09174 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Pde6gP09174 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Pde6gP09174 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Pde6gP09174 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Pde6gP09174 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Pde6gP09174 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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