Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
TtrP07309 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TtrP07309 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TtrP07309 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TtrP07309 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TtrP07309 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TtrP07309 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TtrP07309 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TtrP07309 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TtrP07309 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TtrP07309 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TtrP07309 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TtrP07309 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TtrP07309 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
TtrP07309 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TtrP07309 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
TtrP07309 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TtrP07309 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TtrP07309 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TtrP07309 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TtrP07309 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
TtrP07309 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
TtrP07309 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
TtrP07309 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
TtrP07309 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtrP07309 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtrP07309 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtrP07309 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtrP07309 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtrP07309 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtrP07309 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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TtrP07309 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtrP07309 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtrP07309 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtrP07309 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtrP07309 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtrP07309 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtrP07309 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtrP07309 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtrP07309 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtrP07309 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtrP07309 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtrP07309 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtrP07309 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtrP07309 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtrP07309 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TtrP07309 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtrP07309 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtrP07309 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtrP07309 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtrP07309 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtrP07309 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtrP07309 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtrP07309 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtrP07309 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtrP07309 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtrP07309 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtrP07309 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtrP07309 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtrP07309 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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TtrP07309 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtrP07309 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtrP07309 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtrP07309 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtrP07309 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TtrP07309 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtrP07309 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtrP07309 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtrP07309 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtrP07309 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtrP07309 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtrP07309 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtrP07309 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtrP07309 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
TtrP07309 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtrP07309 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtrP07309 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtrP07309 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
TtrP07309 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtrP07309 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtrP07309 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
TtrP07309 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
TtrP07309 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
TtrP07309 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
TtrP07309 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtrP07309 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
TtrP07309 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
TtrP07309 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtrP07309 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
TtrP07309 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms