Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms