Protein–RNA interactions for Protein: P06320

T-cell receptor beta chain V region CTL-F3, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06320 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P06320 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P06320 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P06320 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P06320 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P06320 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P06320 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P06320 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P06320 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P06320 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P06320 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P06320 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P06320 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P06320 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P06320 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P06320 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P06320 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P06320 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P06320 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P06320 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P06320 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P06320 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P06320 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P06320 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P06320 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P06320 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P06320 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P06320 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P06320 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P06320 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
P06320 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P06320 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P06320 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P06320 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P06320 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P06320 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P06320 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P06320 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06320 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06320 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06320 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06320 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06320 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06320 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06320 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06320 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06320 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06320 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06320 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06320 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06320 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06320 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06320 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06320 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06320 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06320 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06320 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06320 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06320 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06320 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06320 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06320 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06320 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06320 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06320 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06320 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06320 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06320 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06320 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06320 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06320 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06320 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06320 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06320 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P06320 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06320 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06320 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P06320 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06320 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06320 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06320 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06320 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06320 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06320 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06320 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06320 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06320 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06320 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06320 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06320 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06320 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06320 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06320 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06320 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06320 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06320 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06320 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P06320 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P06320 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P06320 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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