Protein–RNA interactions for Protein: P01669

Ig kappa chain V-III region PC 7769, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01669 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01669 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01669 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01669 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01669 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01669 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01669 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01669 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01669 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P01669 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01669 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01669 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01669 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01669 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01669 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01669 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P01669 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P01669 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P01669 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01669 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01669 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01669 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01669 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01669 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01669 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01669 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01669 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01669 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01669 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01669 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01669 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01669 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01669 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01669 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01669 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01669 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01669 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01669 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01669 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01669 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01669 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01669 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01669 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01669 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01669 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01669 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01669 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01669 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01669 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01669 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01669 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01669 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01669 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01669 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01669 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01669 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01669 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01669 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01669 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01669 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01669 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01669 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01669 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01669 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01669 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01669 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01669 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01669 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01669 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01669 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01669 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01669 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01669 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01669 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01669 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01669 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01669 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01669 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01669 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01669 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01669 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01669 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01669 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01669 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01669 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01669 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01669 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01669 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01669 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01669 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01669 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01669 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01669 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01669 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01669 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01669 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01669 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01669 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01669 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01669 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms