Protein–RNA interactions for Protein: P01655

Ig kappa chain V-III region PC 7132, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01655 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P01655 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01655 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01655 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01655 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01655 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01655 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01655 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01655 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01655 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01655 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01655 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01655 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01655 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01655 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01655 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01655 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01655 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01655 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01655 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01655 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01655 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01655 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01655 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01655 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01655 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P01655 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P01655 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01655 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01655 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01655 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01655 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01655 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01655 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01655 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01655 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01655 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01655 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01655 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01655 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01655 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01655 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01655 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01655 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01655 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01655 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01655 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01655 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01655 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01655 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
P01655 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01655 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01655 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01655 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01655 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01655 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01655 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01655 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01655 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01655 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01655 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01655 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01655 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01655 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01655 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01655 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01655 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01655 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01655 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01655 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01655 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01655 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01655 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
P01655 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
P01655 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01655 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01655 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01655 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01655 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
P01655 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01655 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01655 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01655 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01655 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01655 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01655 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01655 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01655 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01655 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01655 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01655 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
P01655 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01655 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01655 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01655 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
P01655 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01655 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01655 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
P01655 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01655 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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