Protein–RNA interactions for Protein: P01635

Ig kappa chain V-V region K2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01635 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01635 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01635 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01635 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01635 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01635 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01635 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01635 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01635 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01635 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01635 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01635 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01635 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01635 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01635 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01635 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01635 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01635 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01635 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01635 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01635 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01635 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01635 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01635 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01635 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01635 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P01635 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01635 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01635 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01635 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01635 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01635 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01635 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01635 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01635 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01635 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01635 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01635 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01635 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01635 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01635 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01635 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01635 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01635 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01635 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01635 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01635 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01635 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01635 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01635 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01635 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01635 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01635 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01635 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01635 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01635 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01635 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01635 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01635 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01635 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01635 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01635 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01635 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01635 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01635 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01635 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01635 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01635 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01635 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01635 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01635 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01635 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01635 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01635 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01635 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01635 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01635 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01635 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01635 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01635 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01635 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01635 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01635 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01635 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01635 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01635 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01635 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01635 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01635 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01635 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01635 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01635 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01635 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01635 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01635 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01635 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01635 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01635 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01635 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01635 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms