Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Ccl20O89093 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccl20O89093 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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