Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MscO88940 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MscO88940 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MscO88940 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MscO88940 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MscO88940 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MscO88940 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MscO88940 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MscO88940 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MscO88940 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MscO88940 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MscO88940 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MscO88940 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MscO88940 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MscO88940 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MscO88940 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MscO88940 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MscO88940 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MscO88940 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MscO88940 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MscO88940 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MscO88940 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MscO88940 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MscO88940 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MscO88940 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MscO88940 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MscO88940 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MscO88940 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MscO88940 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MscO88940 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MscO88940 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MscO88940 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MscO88940 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MscO88940 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MscO88940 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MscO88940 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MscO88940 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MscO88940 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MscO88940 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MscO88940 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MscO88940 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MscO88940 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MscO88940 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MscO88940 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MscO88940 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MscO88940 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MscO88940 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MscO88940 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MscO88940 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MscO88940 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MscO88940 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MscO88940 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MscO88940 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MscO88940 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MscO88940 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MscO88940 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MscO88940 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MscO88940 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MscO88940 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MscO88940 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MscO88940 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MscO88940 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MscO88940 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MscO88940 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MscO88940 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MscO88940 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MscO88940 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MscO88940 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MscO88940 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MscO88940 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MscO88940 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MscO88940 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MscO88940 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MscO88940 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MscO88940 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MscO88940 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MscO88940 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MscO88940 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MscO88940 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MscO88940 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MscO88940 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MscO88940 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MscO88940 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MscO88940 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MscO88940 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MscO88940 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MscO88940 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MscO88940 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MscO88940 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MscO88940 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MscO88940 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MscO88940 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MscO88940 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MscO88940 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MscO88940 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MscO88940 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MscO88940 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MscO88940 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MscO88940 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MscO88940 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms