Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

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Length 146 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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JtbO88824 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JtbO88824 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
JtbO88824 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JtbO88824 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
JtbO88824 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JtbO88824 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JtbO88824 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JtbO88824 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JtbO88824 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JtbO88824 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
JtbO88824 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
JtbO88824 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
JtbO88824 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
JtbO88824 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
JtbO88824 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
JtbO88824 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
JtbO88824 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
JtbO88824 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
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JtbO88824 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
JtbO88824 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
JtbO88824 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
JtbO88824 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
JtbO88824 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
JtbO88824 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
JtbO88824 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
JtbO88824 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
JtbO88824 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
JtbO88824 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
JtbO88824 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
JtbO88824 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
JtbO88824 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
JtbO88824 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
JtbO88824 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
JtbO88824 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
JtbO88824 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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JtbO88824 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
JtbO88824 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
JtbO88824 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
JtbO88824 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
JtbO88824 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
JtbO88824 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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JtbO88824 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
JtbO88824 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
JtbO88824 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
JtbO88824 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
JtbO88824 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
JtbO88824 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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JtbO88824 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
JtbO88824 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
JtbO88824 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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JtbO88824 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
JtbO88824 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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JtbO88824 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
JtbO88824 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
JtbO88824 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
JtbO88824 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
JtbO88824 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
JtbO88824 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
JtbO88824 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
JtbO88824 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
JtbO88824 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
JtbO88824 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
JtbO88824 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
JtbO88824 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
JtbO88824 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
JtbO88824 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
JtbO88824 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
JtbO88824 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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