Protein–RNA interactions for Protein: O88576

Slc6a18, Sodium-dependent neutral amino acid transporter B(0)AT3, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a18O88576 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Slc6a18O88576 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Slc6a18O88576 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Slc6a18O88576 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Slc6a18O88576 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Slc6a18O88576 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Slc6a18O88576 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Slc6a18O88576 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Slc6a18O88576 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Slc6a18O88576 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Slc6a18O88576 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Slc6a18O88576 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Slc6a18O88576 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a18O88576 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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