Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnmt3bO88509 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms