Protein–RNA interactions for Protein: O70172

Pip4k2a, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4k2aO70172 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pip4k2aO70172 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pip4k2aO70172 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pip4k2aO70172 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pip4k2aO70172 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pip4k2aO70172 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pip4k2aO70172 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pip4k2aO70172 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pip4k2aO70172 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pip4k2aO70172 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pip4k2aO70172 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pip4k2aO70172 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pip4k2aO70172 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pip4k2aO70172 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pip4k2aO70172 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms