Protein–RNA interactions for Protein: O70126

Aurkb, Aurora kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkbO70126 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
AurkbO70126 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AurkbO70126 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AurkbO70126 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AurkbO70126 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkbO70126 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkbO70126 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkbO70126 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkbO70126 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms