Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Ldb2O55203 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Ldb2O55203 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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