Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms