Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms