Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NlkO54949 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NlkO54949 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NlkO54949 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NlkO54949 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NlkO54949 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NlkO54949 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NlkO54949 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NlkO54949 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NlkO54949 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NlkO54949 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NlkO54949 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NlkO54949 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NlkO54949 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NlkO54949 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NlkO54949 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NlkO54949 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NlkO54949 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NlkO54949 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NlkO54949 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NlkO54949 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NlkO54949 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NlkO54949 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NlkO54949 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NlkO54949 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NlkO54949 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NlkO54949 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NlkO54949 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NlkO54949 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NlkO54949 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NlkO54949 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NlkO54949 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NlkO54949 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NlkO54949 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NlkO54949 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NlkO54949 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NlkO54949 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NlkO54949 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NlkO54949 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NlkO54949 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NlkO54949 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NlkO54949 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NlkO54949 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NlkO54949 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NlkO54949 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NlkO54949 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NlkO54949 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NlkO54949 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NlkO54949 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NlkO54949 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NlkO54949 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NlkO54949 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NlkO54949 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NlkO54949 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NlkO54949 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NlkO54949 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NlkO54949 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NlkO54949 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NlkO54949 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NlkO54949 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NlkO54949 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NlkO54949 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NlkO54949 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NlkO54949 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NlkO54949 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NlkO54949 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NlkO54949 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NlkO54949 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NlkO54949 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NlkO54949 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NlkO54949 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NlkO54949 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NlkO54949 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NlkO54949 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NlkO54949 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NlkO54949 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NlkO54949 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NlkO54949 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NlkO54949 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NlkO54949 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NlkO54949 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NlkO54949 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NlkO54949 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NlkO54949 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NlkO54949 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NlkO54949 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NlkO54949 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NlkO54949 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NlkO54949 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NlkO54949 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NlkO54949 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NlkO54949 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NlkO54949 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NlkO54949 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NlkO54949 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NlkO54949 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NlkO54949 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NlkO54949 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NlkO54949 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NlkO54949 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms