Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNQ2O43526 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KCNQ2O43526 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KCNQ2O43526 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNQ2O43526 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNQ2O43526 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNQ2O43526 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNQ2O43526 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNQ2O43526 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNQ2O43526 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNQ2O43526 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNQ2O43526 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNQ2O43526 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNQ2O43526 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNQ2O43526 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNQ2O43526 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNQ2O43526 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNQ2O43526 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNQ2O43526 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNQ2O43526 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNQ2O43526 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNQ2O43526 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNQ2O43526 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNQ2O43526 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNQ2O43526 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNQ2O43526 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNQ2O43526 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNQ2O43526 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNQ2O43526 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNQ2O43526 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNQ2O43526 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNQ2O43526 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNQ2O43526 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNQ2O43526 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms