Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms