Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Gm42736-201ENSMUST00000200723 1353 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Gm45399-201ENSMUST00000209955 1016 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Olfr886-ps1-201ENSMUST00000212395 708 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 4833412K13Rik-201ENSMUST00000195509 1479 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 4930433B08Rik-201ENSMUST00000192010 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Pou1f1-205ENSMUST00000184525 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx8O35652 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms