Protein–RNA interactions for Protein: O35473

C1d, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1dO35473 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1dO35473 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1dO35473 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1dO35473 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1dO35473 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1dO35473 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1dO35473 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1dO35473 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1dO35473 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1dO35473 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1dO35473 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1dO35473 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C1dO35473 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1dO35473 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1dO35473 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1dO35473 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1dO35473 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1dO35473 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1dO35473 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1dO35473 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1dO35473 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1dO35473 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1dO35473 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1dO35473 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1dO35473 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1dO35473 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1dO35473 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1dO35473 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1dO35473 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1dO35473 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1dO35473 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1dO35473 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1dO35473 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1dO35473 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1dO35473 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C1dO35473 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1dO35473 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1dO35473 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1dO35473 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1dO35473 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1dO35473 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1dO35473 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1dO35473 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1dO35473 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1dO35473 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1dO35473 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1dO35473 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1dO35473 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1dO35473 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1dO35473 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1dO35473 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1dO35473 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1dO35473 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1dO35473 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1dO35473 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1dO35473 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1dO35473 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1dO35473 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C1dO35473 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1dO35473 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1dO35473 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1dO35473 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1dO35473 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1dO35473 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1dO35473 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1dO35473 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C1dO35473 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
C1dO35473 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C1dO35473 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1dO35473 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1dO35473 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1dO35473 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1dO35473 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1dO35473 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1dO35473 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1dO35473 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1dO35473 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C1dO35473 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1dO35473 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1dO35473 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1dO35473 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1dO35473 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1dO35473 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1dO35473 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1dO35473 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1dO35473 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1dO35473 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1dO35473 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1dO35473 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1dO35473 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1dO35473 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1dO35473 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1dO35473 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1dO35473 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1dO35473 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1dO35473 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1dO35473 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1dO35473 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1dO35473 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1dO35473 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms