Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-ObO35424 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms