Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna6O35345 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna6O35345 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna6O35345 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna6O35345 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna6O35345 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna6O35345 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna6O35345 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna6O35345 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms