Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms