Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna4O35343 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms