Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ebi3O35228 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ebi3O35228 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ebi3O35228 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ebi3O35228 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ebi3O35228 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ebi3O35228 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Ebi3O35228 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ebi3O35228 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ebi3O35228 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ebi3O35228 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ebi3O35228 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ebi3O35228 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ebi3O35228 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ebi3O35228 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ebi3O35228 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ebi3O35228 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ebi3O35228 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ebi3O35228 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ebi3O35228 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ebi3O35228 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ebi3O35228 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ebi3O35228 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ebi3O35228 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ebi3O35228 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ebi3O35228 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ebi3O35228 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ebi3O35228 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ebi3O35228 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ebi3O35228 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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