Protein–RNA interactions for Protein: O35214

Rrh, Visual pigment-like receptor peropsin, mousemouse

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Length 337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RrhO35214 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RrhO35214 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RrhO35214 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RrhO35214 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RrhO35214 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RrhO35214 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RrhO35214 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RrhO35214 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RrhO35214 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RrhO35214 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RrhO35214 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RrhO35214 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RrhO35214 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RrhO35214 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RrhO35214 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RrhO35214 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RrhO35214 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RrhO35214 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RrhO35214 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RrhO35214 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RrhO35214 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RrhO35214 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RrhO35214 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RrhO35214 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RrhO35214 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RrhO35214 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RrhO35214 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RrhO35214 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RrhO35214 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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RrhO35214 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RrhO35214 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RrhO35214 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RrhO35214 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RrhO35214 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RrhO35214 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RrhO35214 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RrhO35214 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RrhO35214 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RrhO35214 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RrhO35214 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RrhO35214 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RrhO35214 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RrhO35214 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RrhO35214 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RrhO35214 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RrhO35214 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RrhO35214 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RrhO35214 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RrhO35214 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RrhO35214 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RrhO35214 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RrhO35214 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RrhO35214 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RrhO35214 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RrhO35214 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RrhO35214 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RrhO35214 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RrhO35214 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RrhO35214 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RrhO35214 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RrhO35214 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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RrhO35214 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RrhO35214 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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RrhO35214 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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RrhO35214 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RrhO35214 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RrhO35214 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RrhO35214 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RrhO35214 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RrhO35214 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RrhO35214 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RrhO35214 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RrhO35214 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RrhO35214 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RrhO35214 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RrhO35214 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RrhO35214 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RrhO35214 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RrhO35214 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RrhO35214 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RrhO35214 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RrhO35214 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RrhO35214 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RrhO35214 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RrhO35214 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RrhO35214 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RrhO35214 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RrhO35214 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RrhO35214 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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RrhO35214 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RrhO35214 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RrhO35214 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms