Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pitx3O35160 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms