Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Polr1aO35134 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms