Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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