Protein–RNA interactions for Protein: L7N471

Gm7980, Predicted gene 7980 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7980L7N471 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm7980L7N471 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm7980L7N471 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm7980L7N471 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm7980L7N471 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm7980L7N471 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm7980L7N471 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm7980L7N471 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm7980L7N471 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm7980L7N471 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm7980L7N471 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm7980L7N471 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm7980L7N471 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm7980L7N471 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm7980L7N471 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm7980L7N471 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm7980L7N471 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm7980L7N471 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm7980L7N471 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm7980L7N471 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm7980L7N471 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm7980L7N471 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm7980L7N471 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm7980L7N471 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm7980L7N471 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm7980L7N471 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm7980L7N471 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm7980L7N471 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm7980L7N471 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm7980L7N471 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm7980L7N471 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm7980L7N471 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm7980L7N471 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm7980L7N471 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm7980L7N471 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm7980L7N471 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm7980L7N471 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm7980L7N471 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm7980L7N471 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm7980L7N471 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm7980L7N471 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm7980L7N471 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm7980L7N471 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms