Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccer2J3QPU5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms