Protein–RNA interactions for Protein: J3QNX5

Shisa8, Cysteine-knot AMPAR-modulating protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa8J3QNX5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Shisa8J3QNX5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms