Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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